1、生物顯微鏡用的是透射照明，一般用來觀察透時和半透明的樣本，不能用來觀察不透明物體，而金相顯微鏡主要是落射照明方式（也叫同軸照明），光源從物鏡射出，主要用于觀察不透明樣本的表面，當然也有附帶透射照明裝置的較金相顯微鏡，可同時用于觀察透明樣本。

　　2、從物鏡來看，生物顯微鏡的高倍物鏡都有考慮蓋玻片厚度（0.17）和載玻片、培養器皿厚度（1.2），所以其物鏡是通常標有 /0.17（正置顯微鏡）、 /1.2（倒置顯微鏡），正置生物顯微鏡10倍以下物鏡則是 /-，也就是可以不考慮，這是為了校正玻璃對于光折射的影響，而金相顯微鏡的物鏡通常標有/0 。

　　金相顯微鏡是常規檢驗和研究工作中zui常使用的儀器，金相顯微鏡電子目鏡分辨率達到130-300萬像素，適用于任何標準的生物顯微鏡、體視顯微鏡、金相顯微鏡的拍攝，可以廣泛的用于醫療衛生機構、實驗室、研究所，高等學校做生物學、病理學、細菌學觀察、教學和研究，臨床實驗和常規醫療檢驗，工廠、實驗室對材料的分析和鑒定。

　　金相顯微鏡電子目鏡的功能特點如下：

　　1、安裝簡單，即插即用；

　　2、操作簡單；

　　3、共享性強，可隨時對圖像進行編輯、處理、保存、傳輸數據等。